Durante dos años, entre 1992 y 1994, el Atlético de Madrid no tuvo categorías inferiores. En junio de 1992 el entonces presidente del Atlético de Madrid, Jesús Gil, camiseta barça suprimió las categorías inferiores del Club por considerarlas inviables económicamente. La zona de captación de jóvenes futbolistas se expande por todo el país a través de una amplia red de ojeadores que trabajan para el Atlético.
2009 y 2010), dos subcampeonatos de Copa (2007 y 2011) y tres subcampeonatos de Liga (2006-07, 2009-10 y 2010-11), muestra de la gran regularidad de las jugadoras periquitas. Dispone de un equipo filial masculino que alzó una Copa de la Liga de Segunda División y fue subcampeón de Segunda División -además de contar con un filial femenino-. Cuenta igualmente con una academia de fútbol base para ambos sexos, con numerosos éxitos en el país.
